Molekulárně genetická diagnostika

Molekulární patologie využívá širokou škálu molekulárně genetických a cytogenetických diagnostických metod pro vyšetřování prediktivních a prognostických markerů u nádorových onemocnění. Pracoviště je akreditováno Českým institutem pro akreditaci o.p.s. podle ČSN EN ISO 15189:2013 a má status referenční laboratoře pro provádění výkonů prediktivní diagnostiky.

Seznam prováděných vyšetření (metody)

KARCINOM PRSU

Amplifikace genu HER2/ERBB2 (fluorescenční in situ hybridizace)
Prediktivní testování u karcinomu prsu - DNA panel (NGS)
Prediktivní testování u karcinomu prsu - RNA panel (NGS)

KARCINOM ŽALUDKU

Amplifikace genu HER2/ERBB2 (fluorescenční in situ hybridizace)

NSCLC

Přestavby genu ALK (fluorescenční in situ hybridizace)
Přestavby genu ROS1 (fluorescenční in situ hybridizace)
Mutace genu EGFR (reverzní hybridizace, real-time PCR IDYLLA, NGS)
Prediktivní testování u NSCLC - DNA panel (NGS)
Prediktivní testování u NSCLC - RNA panel (NGS)

KOLOREKTÁLNÍ KARCINOM

Mutace genu KRAS (reverzní hybridizace, real-time PCR IDYLLA, NGS)
Mutace genu NRAS (reverzní hybridizace, real-time PCR IDYLLA, NGS)
Mutace genu BRAF (reverzní hybridizace, real-time PCR IDYLLA, NGS)
Prediktivní testování u kolorektálního karcinomu - DNA panel (NGS)
Prediktivní testování u kolorektálního karcinomu - RNA panel (NGS)

MELANOMY

Mutace genu BRAF (reverzní hybridizace, real-time PCR IDYLLA, NGS)

LYMFOMY

Klonální přestavby IgH, IgL, IgK a TCR (PCR s následnou heteroduplexní analýzou)
DLBCL – zlom genu MYC, BCL2 a BCL6
FL – translokace t (14;18) (q32;q21)
Mantle cell lymfom – translokace t (11;14) (q13;q32)
Anaplastický velkobuněčný lymfom – zlom genu ALK
MALT lymfom – zlom genu MALT, translokace t (11;18)(q21;q21)
SSL - del 11q23; trizomie 12, del 13q14, del 17p13

KARCINOMY NEZNÁMÉHO PŮVODU

Prediktivní testování u nádorů neznámého primárního zdroje a dalších solidních nádorů -
DNA panel (NGS)
Prediktivní testování u nádorů neznámého primárního zdroje a dalších solidních nádorů -
RNA panel (NGS)

NGS (Next Generation sequencing)