DNA laboratoř

Seznam vyšetření prováděných v laboratořích Krevního centra FNO.

Adobe PDF | velikost 0,1 MB

V DNA laboratoři KC provádíme vyšetření HLA, HPA a některých krevních systémů, např. ABO, Rh, Kell, Kid, Duffy metodou PCR - SSP (polymerázová řetězová reakce se sekvenčně specifickými primery).

HLA systém ( Human Lekocyte Antigens) vyšetřujeme u pacientů se selháním ledvin, kteří jsou zařazeni do transplantačního programu. HLA typizaci dále provádíme u leukemických pacientů a jejich příbuzných v rámci rodinné studie (rodiče, sourozenci). Pro potřeby transplantačního centra FNO typizujeme dárce orgánů, a to kadaverózní nebo živé dárce - ledvina jako párový orgán může být darována. Pro pacienty s autoimunním onemocněním, u kterého se předpokládá vztah s HLA systémem, testujeme přítomnost určité HLA alely. Např. celiakie je asociována s DQB1*0201, narkolepsie s DQB1*0602.

HPA systém trombocytů (Human Platelet Antigens) má smysl vyšetřovat v rodině s podezřením na fetomaternální aloimunní trombocytopenii - snížený počet trombocytů u novorozence v důsledku aloimunizace matky fetálními trombocyty. Příčinou je neshoda HPA antigenů matky a plodu. Typizace HPA u matky pomáhá spolu s vyšetřením trombocytárních protilátek v matčině séru k uzavření diagnózy.

Krevní skupinové systémy se běžně vyšetřují sérologicky. V určitých případech je však nutné provést vyšetření na úrovni DNA: u novorozenců, dokud nejsou exprimovány antigeny na krvinkách, u pacientů s AIHA, či na dořešení slabého nebo variantního RhD antigenu.

Druhou skupinu vyšetřování v DNA laboratoři jsou trombofílní mutace. Používáme dvě metody: PCR ASA (PCR s alelově specifickými primery) a real time PCR (PCR v reálném čase).

Za nejrozšířenější a nejzávažnější je považovaná FV Leiden (G1691A), která je vrozenou příčinou asi u 40% trombóz. Relativní riziko vzniku trombózy je u homozygotů FV Leiden zvýšeno 80 x, u heterozygotů 8x. Druhá v pořadí, co do závažnosti, je protrombinová mutace (G20210A). Heterozygoti protrombinové mutace mají 4x vyšší riziko vzniku trombózy.

Dvě bodové mutace v genu pro methylentetrahydrofolát reduktázu (MTHFR C677T, A1298C). Jejich přítomnost v genu vede k termolabilitě kódovaného enzymu. MTHFR je jedním z enzymů metabolismu methioninu a předpokládá se, že mutovaná forma MTHFR může být příčinou poruchy metylace homocysteinu na methionin. Zvýšené hladiny homocysteinu (nad 12 M/l) jsou považovány za nezávislý rizikový faktor trombózy v arteriálním i žilním řečišti. U homozygotů se předpokládá asi 2,5 x vyšší riziko vzniku trombózy.

Poslední z nabízených vyšetření mutací je polymorfismus 4G/5G v genu pro inhibitor aktivátoru plazminogenu (PAI-1). Homozygotní forma 4G/4G vede ke zvýšení hladiny PAI-1 a tím ke snížené aktivaci fibrinolýzy. U nosičů polymorfismu 4G/4G je asi 2 x vyšší riziko vzniku infarktu myokardu.

DNA laboratoř provádí vyšetření pro paternitní spory -11 STR systémů a 1 VNTR systém.